Центр экспертиз Всероссийского центра карантина растений состоит из двух отделов: по работе с заказчиками и исследования карантинного фитосанитарного состояния подкарантинных материалов. Здесь консультируют, заключают договоры с заказчиками на исследование продукции, а специалисты отдела выезжают на отбор проб.