Сюжет Действие игры разворачивается в конце 1988 года в Японии, в период экономического пузыря, за семнадцать лет до событий оригинальной Yakuza. Сюжет следует за двумя протагонистами — молодыми Кадзумой Кирю и Горо Мадзимой, которые, находясь в разных городах, оказываются втянутыми в жестокий конфликт между различными фракциями якудза за контроль над небольшим, но критически важным участком земли, известным как «Пустой участок».