Сюжет Alien: Rogue Incursion Evolved Edition разворачивается вокруг морпеха Зулы Хендрикс, которая вместе с напарником-синтом Дэвисом-01 получает сигнал бедствия от своего боевого товарища. Полёт к планете Пурдан заканчивается крушением корабля, а на поверхности героев встречает станция «Вейланд-Ютани», кишащая ксеноморфами.