Игра является прямым продолжением первой части игровой франшизы Вселенной Метро 2033, вышедшей в 2010 году. Как и в предыдущей игре, главным героем является молодой солдат Артём, живущий в московском метро после разрушительной ядерной войны. Поставив перед собой задачу найти таинственного Чёрного, выжившего после событий Metro 2033