Игра представляет собой сочетание классического геймплея серии Ninja Gaiden с современными элементами, такими как глубокая боевая система и улучшенная графика. Сюжет игры начинается с того, что Рю Хаябуса отправляется в Америку, чтобы исполнить волю своего отца. В это время барьер между миром людей и демонов рушится, и ужасающая армия вторгается в деревню Хаябуса. В отсутствие Рю, молодой ниндзя Кенджи Модзу решает сам противостоять этой угрозе.