Действие Burial at Sea разворачивается уже не в небесном городе Колумбия в 1913 году, а в подводном Восторге в 1958 году. В первом эпизоде протагонист BioShock Infinite Букер ДеВитт по поручению героини Элизабет расследует исчезновение девочки по имени Салли. Букер находит Салли, но обнаруживает, что она была превращена в «Младшую сестру» — умственно отсталую и мутировавшую девочку, обученную производить и собирать материал, который подпитывает генетические модификации Восторга. Во втором эпизоде игровым персонажем становится уже сама Элизабет — она вынуждена заключить сделку с антагонистом Атласом и узнаёт о связях между Восторгом и Колумбией, существующих в параллельных мирах.