Сюжет продолжает линию оригинальной Tomb Raider 2013 года. Главная героиня Лара Крофт отправляется в Сибирь на поиски мистического и забытого города Китежа. В её путешествие ей помогает Иона Майава. На пути Лары встаёт мистическая организация «Тринити» («Троица»), преследовавшая её с момента отбытия с острова Яматай.