Сегодня Иркутский государственный университет является крупным научным и образовательным учреждением естественно-научного и гуманитарного профилей. Образовательный комплекс включает 5 учебных институтов, 10 факультетов, 2 филиала, зональную научную библиотеку - одну из крупнейших вузовских библиотек России, аспирантуру, магистратуру, докторантуру и Иркутский виртуальный университет, являющийся базовым в регионе. В настоящее время в структуре университета 8 крупных научных подразделений: научно-исследовательская часть (НИЧ), 3 научно-исследовательских института (прикладной физики, нефте- и углехимического синтеза, биологии), Центр новых информационных технологий (ЦНИТ), НОЦ «Байкал», Межрегиональный институт общественных наук (МИОН), научно-исследовательский центр «Байкальский регион».